祖屋涉及拆迁时常常会发生房屋土地产权分不清楚的情况。祖屋里面住的人往往可能都没有房产证；有的部分有房产证没有土地证；还有的持有土改时的《土地房屋所有证》，但是房屋又存在拆改的情况与《房屋土地所有证》记载内容不符。

有的共有权人擅自以房屋属于无主财产等理由向房管部门申请颁发房产证、土地证。由于拆迁在即，有的地方政府为了加快拆迁速度，按照无主房屋的处置办法及长期居住等事实情况向申请人颁发房产证或土地证。